Il sistema di secrezione di tipo III è una appendice proteica presente in diversi batteri Gram-negativi.
Nei batteri patogeni, questa struttura ad ago viene utilizzata come sonda sensoriale per rilevare la presenza di organismi eucarioti e a secernere proteine che aiutano i batteri a infettarli. Le proteine effettrici vengono secrete direttamente dalla cellula batterica nella cellula eucariotica (ospite), dove esercitano una serie di effetti che aiutano il patogeno a sopravvivere e a sfuggire a una risposta immunitaria.
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